全稱Protein-protein interaction（蛋?質-蛋?質相互作?）。
指兩(liang)個或兩(liang)個以上的蛋(dan)?質(zhi)分?通過?共價鍵形成蛋(dan)?質(zhi)復合體的過程。
全(quan)稱Foldchange（差異倍數）。說明蛋?表達變化是(shi)否顯著。
先(xian)?蛋(dan)?酶把蛋(dan)?序(xu)列(lie)(lie)進(jin)?酶切，再針對酶切后的(de)肽段(duan)進(jin)?鑒定，所以進(jin)?質譜的(de)檢測對象(xiang)永(yong)遠是肽段(duan)，再根據肽段(duan)序(xu)列(lie)(lie)再推(tui)導出蛋(dan)?序(xu)列(lie)(lie)，也(ye)就是我們常說的(de)shotgun?法
是指從?個完整的蛋(dan)?出發，在(zai)質譜中(zhong)進?碎(sui)(sui)?化處理(li)，通過對碎(sui)(sui)?分?的檢測，推導出蛋(dan)?的序(xu)列。
可(ke)變修(xiu)(xiu)飾(shi)是(shi)(shi)(shi)指這種修(xiu)(xiu)飾(shi)不(bu)是(shi)(shi)(shi)穩定(ding)存在(zai)，不(bu)是(shi)(shi)(shi)所有肽段都存在(zai)的(de)(de)，有可(ke)能是(shi)(shi)(shi)可(ke)逆修(xiu)(xiu)飾(shi)，也有可(ke)能化(hua)學修(xiu)(xiu)飾(shi)發?的(de)(de)概率不(bu)是(shi)(shi)(shi)100%等(deng)等(deng)。
是指(zhi)所(suo)有(you)肽段上(shang)都穩定存在的?種(zhong)修飾(shi)，?般是添加(jia)烷基化修飾(shi)，是在樣(yang)本制備過程中?為加(jia)進(jin)去的化學(xue)反應(ying)，使(shi)所(suo)有(you)肽段都發?了(le)這個修飾(shi)。
全稱Peptide-Spectrum matching（匹配到(dao)的譜(pu)圖(tu)數(shu)）。指將實(shi)際采集到(dao)的譜(pu)圖(tu)與理論譜(pu)圖(tu)庫進(jin)??對，當實(shi)際譜(pu)圖(tu)能(neng)匹配上肽段(duan)時，則記作?張PSM。
