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中藥現代化:蛋白質組學在中藥作用機制研究中的應用

歷經千年的傳承,中藥的有效性、實用性和科學性已毋庸置疑,但是其多成分、多靶點、多層次的作用特點給作用機制的研究帶來困難,阻礙了中藥的現代化和國際化進程。蛋白質組學技術是從整體的角度分析細胞內動態變化的蛋白質的組成與活動規律,與中藥的“整體觀”和“動態觀”不謀而合,為闡明中藥作用機制帶來了曙光。

近年,蛋白質組學技術在中藥作用機制和藥物靶點研究(>>>中藥靶點研究攻略:一文精通中藥靶點研究思路)中的應用取得了實質性的進展。本期,我們將探討蛋白質組學如何助力中藥研究,深入理解其在中藥作用機制中的關鍵角色。讓我們一探究竟,掌握中藥作用機制研究的新思路!

 

TMT定量蛋白質組學揭示小青龍湯對中性粒細胞性哮喘的保護作用

2024年8月,廣州中醫藥大學第一附屬醫院黃秀芳團隊在期刊J Ethnopharmacol (IF=4.8)上發表了題為“Integrative analysis of network pharmacology and proteomics reveal the protective effect of Xiaoqinglong Decotion on neutrophilic asthma”的研究論文,該研究以中性粒細胞性哮喘組小鼠為研究對象,平行設置對照組、地塞米松治療組、低/中/高劑量小青龍湯(XQLD)治療組,利用網絡藥理學、TMT定量蛋白質組學和動物實驗等發現XQLD通過抑制鐵死亡途徑和ARG1、MMP12、SPP1表達,以及激活Rap1信號通路,有效改善了嗜中性粒細胞性哮喘小鼠的氣道炎癥。

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TMT定量蛋白質組學揭示小青龍湯對中性粒細胞性哮喘的保護作用[1]


TMT定量蛋白質組學揭示土茯苓治療高血壓的分子機制

2024年5月,貴州中醫藥大學錢海兵團隊在期刊Front Pharmacol (IF= 4.4)上發表了題為“Investigation of the molecular mechanism of Smilax glabra Roxb. in treating hypertension based on proteomics and bioinformatics”的研究論文,該研究以高血壓大鼠為研究對象,平行設置對照組、模型組、陰性對照組和低/中/高劑量土茯苓(SGR)治療組,利用TMT定量蛋白質組學、藥物成分鑒定、蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)網絡分析和分子對接發現SGR通過調節ALDH2等核心靶標,可能影響多種免疫細胞的浸潤,從而對高血壓產生治療作用。

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TMT定量蛋白質組學揭示土茯苓治療高血壓的分子機制[2]


TMT定量蛋白質組學揭示人參皂苷Re抗心肌缺血的潛在靶標

2024年5月,福建醫科大學李少光團隊在期刊Phytomedicine (IF=6.7)上發表了題為“Integration of network pharmacology and proteomics analysis to identify key target pathways of Ginsenoside Re for myocardial ischemia”的研究論文,該研究以心肌缺血小鼠為研究對象,平行設置對照組、模型組和人參皂苷(Re)治療組,利用藥效學研究、網絡藥理學、分子對接和TMT定量蛋白質組學發現人參皂苷Re可能通過靶向MAPK、AKT、AMPK和鐵死亡途徑來預防和/或治療心肌缺血損傷,并保護心肌細胞免受氧化損傷。

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TMT定量蛋白質組學揭示人參皂苷Re抗心肌缺血的潛在靶標[3]


TMT定量蛋白質組學揭示消癭湯治療格雷夫斯病的機制

2024年5月,南京中醫藥大學附屬中西醫結合醫院朱粉霞團隊在期刊J Ethnopharmacol (IF= 4.8)上發表了題為“Investigating the mechanism and efficacy material basis of Xiehuo Xiaoying decoction for treating Graves' disease via thyroid cell apoptosis based on proteomics and molecular docking techniques”的研究論文,該研究以格雷夫斯病(GD)小鼠為研究對象,平行設置模型組、低/高劑量消癭湯治療組和GPS(龍膽苦苷)治療組,利用藥效學研究、藥物成分鑒定、TMT定量蛋白質組學和分子對接等發現GPS是XHXY治療GD的主要有效物質基礎,XHXY通過促進甲狀腺細胞凋亡發揮治療GD的療效,這一過程涉及到上調FADD、Caspase 8和Caspase 3的表達。

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TMT定量蛋白質組學揭示消癭湯治療格雷夫斯病的機制[4]


4D定量蛋白質組學揭示益氣除痰方抑制肺癌的機制

2024年1月,廣州中醫藥大學張曉君團隊在期刊J Ethnopharmacol (IF=4.8)上發表了題為“Yi Qi Chu Tan Formula (YQCTF) inhibited the progress of lung cancer via regulating tumor-associated neutrophil: An integrated study of network pharmacology, proteomics and pharmacodynamics”的研究論文,該研究以肺癌小鼠為研究對象,平行設置對照組以及益氣除痰方(YQCTF-AE)治療組,利用網絡藥理學、藥物成分鑒定、藥效學研究和4D定量蛋白質組學發現YQCTF抑制了小鼠NSCLC異種移植物的進展,抑制了促腫瘤的腫瘤相關中性粒細胞,并改善了腫瘤免疫微環境(TIME)。

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4D定量蛋白質組學揭示益氣除痰方抑制肺癌的機制[5]


蛋白質組學在中藥作用機制研究中的思路

中藥作用機制的研究是藥物開發和生命科學領域的熱點話題,對于中藥現代化至關重要。本文分享了中藥研究的新策略,強調了蛋白質組學在其中的關鍵作用。通過比較中藥處理前后的蛋白質組學變化,我們能夠發現潛在的治療靶點和信號通路,為中藥的現代化進程注入新動力。讓我們一起探索這一領域的最新進展,推動中藥研究向前發展!

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蛋白質組學在中藥作用機制研究中的思路

【參考文獻】

[1] Liao G, Yan Q, Zhang M, et al. Integrative analysis of network pharmacology and proteomics reveal the protective effect of Xiaoqinglong Decotion on neutrophilic asthma [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 330.

[2] Yang X, Qian H, Yang C, et al. Investigation of the molecular mechanism of Smilax glabra Roxb. in treating hypertension based on proteomics and bioinformatics [J]. Frontiers in Pharmacology, 2024, 15.

[3] Cai J, Zhan Y, Huang K, et al. Integration of network pharmacology and proteomics analysis to identify key target pathways of Ginsenoside Re for myocardial ischemia [J]. Phytomedicine, 2024, 132.

[4] Xiang P, Li Q, Cui G, et al. Investigating the mechanism and efficacy material basis of Xiehuo Xiaoying decoction for treating Graves' disease via thyroid cell apoptosis based on proteomics and molecular docking techniques [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 324.

[5] Le-Xin C, Ming-Jun L, Chun-Qi X, et al. Yi Qi Chu Tan Formula (YQCTF) inhibited the progress of lung cancer via regulating tumor-associated neutrophil: An integrated study of network pharmacology, proteomics and pharmacodynamics [J]. Journal of Ethnopharmacology, 2024, 318.

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